Kaupungin ylintä päätösvaltaa käyttää asukkaiden valitsema valtuusto. Valtuuston jäsenet ja varajäsenet valitaan kunnallisvaaleissa vaalivuotta seuraaviksi neljäksi kalenterivuodeksi. Tällä hetkellä Kokemäellä on 27 valtuutettua. Kuntalain mukaan kaupunginvaltuusto vastaa kaupungin toiminnasta ja taloudesta. Kaupunginvaltuusto voi siirtää valtaansa edelleen muille toimielimille sekä luottamushenkilöille ja viranhaltijoille. Kaupunginvaltuuston kokoukset pidetään pääsääntöisesti Vanhan yhteiskoulun juhlasalissa (osoite Tulkkilantie 16 B, Kokemäki). Kokouksia voi seurata kuka tahansa, sillä kokoukset ovat julkisia. Kaupunginvaltuuston esittelijänä toimii kaupunginhallitus ja sihteerinä hallintojohtaja.
Valtuusto valitsee kaupunginhallituksen, joka vastaa kaupungin hallinnon ja taloudenhoidon toimeenpanosta, valmistelee valtuustoasiat, valvoo kaupungin etua sekä edustaa kaupunkia.